南寧市科技館位于桂花路與銅鼓嶺路交叉路口南側，實際用地面積3.3萬平方米，總建筑面積2.9萬平方米，館內常設科普展區面積約1.05萬平方米。科技館有兩大主體建筑，一是主體展館，二是科學大會堂。展館前有開放廣場，館內配有地下停車場。

主體展館為接待游客、開辦常設展覽、臨時展覽的主要場所，分為A、B、C、D、E五館。A館為臨時展廳，內設有4D影院；B、C、D、E為常設展廳。其中A館兩層；B館三層；C館五層；D館三層；E館為錐形單層建筑。辦公區域設在C館頂層。

科學會堂主要供舉辦大中小型會議、晚會活動使用。會堂分為兩層，內設一大型會議室，一圓桌會議室、兩間小會議室，排練室、準備室等。